代表水晶有黑碧玺、黑曜石、黑发晶、黑玛瑙、茶水晶等深色一类的水晶。纯净时形成无色透明的晶体，当含微量元素Al、Fe等时呈紫色、黄色、茶色等，经辐照微量元素形成不同类型的色心，含伴生包裹体矿物的被称之为包裹体水晶，内包物为金红石、电气石、阳起石、云母、绿泥石等。